Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR3Q9P2K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR3Q9P2K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR3Q9P2K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCOR3Q9P2K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCOR3Q9P2K3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCOR3Q9P2K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RCOR3Q9P2K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCOR3Q9P2K3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms