Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A12Q9NXJ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A12Q9NXJ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms