Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC177Q9NQR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC177Q9NQR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC177Q9NQR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC177Q9NQR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC177Q9NQR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC177Q9NQR7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC177Q9NQR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC177Q9NQR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC177Q9NQR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms