Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA6CQ9H3T2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA6CQ9H3T2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA6CQ9H3T2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms