Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSPH6AQ9H0K4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSPH6AQ9H0K4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RSPH6AQ9H0K4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
RSPH6AQ9H0K4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms