Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRTNQ9H040 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRTNQ9H040 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms