Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNGAP1Q96PV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNGAP1Q96PV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNGAP1Q96PV0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNGAP1Q96PV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms