Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A6EQ96DS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A6EQ96DS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A6EQ96DS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A6EQ96DS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A6EQ96DS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms