Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMAQ96B86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMAQ96B86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMAQ96B86 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGMAQ96B86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms