Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP3Q969Y2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP3Q969Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP3Q969Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTPBP3Q969Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTPBP3Q969Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP3Q969Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP3Q969Y2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms