Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKD1Q969G9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKD1Q969G9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD1Q969G9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD1Q969G9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NKD1Q969G9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1158.6 ms