Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TRIM41Q8WV44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TRIM41Q8WV44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
TRIM41Q8WV44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.24■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
TRIM41Q8WV44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TRIM41Q8WV44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms