RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380711.3

CHKB-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHKB-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-AS1-201ENST00000380711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58■■■■■ 6.88
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 NACADO15069 1562 aa49.32■■■■■ 5.49
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 SMARCA2P51531 1590 aa45.24■■■■■ 4.83
CHKB-AS1-201ENST00000380711 HMGXB3Q12766 1538 aa45.19■■■■■ 4.82
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CUX2O14529 1486 aa45.13■■■■■ 4.82
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERCC6Q03468 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.54■■■■■ 4.72
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.26■■■■■ 4.68
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.9■■■■■ 4.62
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.69■■■■■ 4.58
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.62■■■■■ 4.57
CHKB-AS1-201ENST00000380711 CFTRP13569 1480 aa43.6■■■■■ 4.57
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 OSCARQ8IYS5 282 aa43.01■■■■■ 4.48
CHKB-AS1-201ENST00000380711 IFT140Q96RY7 1462 aa42.84■■■■■ 4.45
CHKB-AS1-201ENST00000380711 TOPBP1Q92547 1522 aa42.78■■■■■ 4.44
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 SYNJ2O15056 1496 aa41.68■■■■■ 4.26
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.59■■■■■ 4.25
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.53■■■■■ 4.24
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 GRIN2AQ12879 1464 aa41.26■■■■■ 4.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ADAMTS12P58397 1594 aa41.23■■■■■ 4.19
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.07■■■■■ 4.16
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.48■■■■■ 4.07
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