RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380711.3

CHKB-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHKB-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-AS1-201ENST00000380711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58■■■■■ 6.88
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 CFTRP13569 1480 aa43.6■■■■■ 4.57
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 IFT140Q96RY7 1462 aa42.84■■■■■ 4.45
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.53■■■■■ 4.24
CHKB-AS1-201ENST00000380711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 GRIN2AQ12879 1464 aa41.26■■■■■ 4.2
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ADAMTS12P58397 1594 aa41.23■■■■■ 4.19
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 CEP170Q5SW79 1584 aa41.12■■■■■ 4.17
CHKB-AS1-201ENST00000380711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.07■■■■■ 4.16
CHKB-AS1-201ENST00000380711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
CHKB-AS1-201ENST00000380711 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
CHKB-AS1-201ENST00000380711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
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CHKB-AS1-201ENST00000380711 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.48■■■■■ 4.07
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