Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRRC29Q8WV35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC29Q8WV35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC29Q8WV35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms