Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF38AQ8NAV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF38AQ8NAV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38AQ8NAV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38AQ8NAV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF38AQ8NAV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms