Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf106Q8NAJ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf106Q8NAJ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf106Q8NAJ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms