Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1B4

VPS52, Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS52Q8N1B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS52Q8N1B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS52Q8N1B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS52Q8N1B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS52Q8N1B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS52Q8N1B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms