Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARFQ8N187 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARFQ8N187 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CARFQ8N187 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARFQ8N187 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms