Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN4BQ8IWT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN4BQ8IWT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCN4BQ8IWT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN4BQ8IWT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms