Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RBBP6Q7Z6E9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBBP6Q7Z6E9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBBP6Q7Z6E9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBBP6Q7Z6E9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms