Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC3Q7Z5M5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC3Q7Z5M5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC3Q7Z5M5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC3Q7Z5M5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms