Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSF3Q4G176 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSF3Q4G176 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSF3Q4G176 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSF3Q4G176 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms