Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY1Q16526 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRY1Q16526 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY1Q16526 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRY1Q16526 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms