Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LAMA4Q16363 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMA4Q16363 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA4Q16363 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMA4Q16363 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMA4Q16363 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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