Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHAF1AQ13111 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CHAF1AQ13111 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CHAF1AQ13111 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHAF1AQ13111 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHAF1AQ13111 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHAF1AQ13111 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
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