Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPI1P60174 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TPI1P60174 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPI1P60174 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPI1P60174 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPI1P60174 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPI1P60174 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPI1P60174 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPI1P60174 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPI1P60174 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPI1P60174 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPI1P60174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPI1P60174 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPI1P60174 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPI1P60174 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPI1P60174 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPI1P60174 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPI1P60174 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPI1P60174 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPI1P60174 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPI1P60174 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TPI1P60174 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TPI1P60174 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPI1P60174 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPI1P60174 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPI1P60174 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPI1P60174 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPI1P60174 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPI1P60174 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPI1P60174 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPI1P60174 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPI1P60174 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TPI1P60174 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPI1P60174 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPI1P60174 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPI1P60174 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPI1P60174 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPI1P60174 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPI1P60174 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPI1P60174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPI1P60174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPI1P60174 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPI1P60174 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPI1P60174 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPI1P60174 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPI1P60174 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPI1P60174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPI1P60174 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPI1P60174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPI1P60174 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPI1P60174 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPI1P60174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPI1P60174 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPI1P60174 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPI1P60174 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPI1P60174 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPI1P60174 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPI1P60174 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPI1P60174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPI1P60174 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPI1P60174 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPI1P60174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPI1P60174 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPI1P60174 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPI1P60174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms