Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR4P51571 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR4P51571 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR4P51571 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR4P51571 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR4P51571 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR4P51571 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR4P51571 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR4P51571 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR4P51571 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR4P51571 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR4P51571 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR4P51571 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR4P51571 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR4P51571 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR4P51571 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR4P51571 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR4P51571 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR4P51571 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR4P51571 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR4P51571 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR4P51571 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR4P51571 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR4P51571 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR4P51571 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSR4P51571 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR4P51571 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR4P51571 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR4P51571 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR4P51571 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR4P51571 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR4P51571 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR4P51571 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR4P51571 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR4P51571 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR4P51571 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR4P51571 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR4P51571 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR4P51571 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR4P51571 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR4P51571 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR4P51571 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR4P51571 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR4P51571 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR4P51571 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR4P51571 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR4P51571 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR4P51571 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR4P51571 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR4P51571 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR4P51571 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR4P51571 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR4P51571 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR4P51571 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR4P51571 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR4P51571 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR4P51571 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR4P51571 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR4P51571 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR4P51571 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR4P51571 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR4P51571 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR4P51571 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR4P51571 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR4P51571 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR4P51571 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms