Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CLIP1P30622 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CLIP1P30622 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLIP1P30622 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CLIP1P30622 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CLIP1P30622 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms