Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDCP19113 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDCP19113 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDCP19113 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDCP19113 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDCP19113 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDCP19113 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDCP19113 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDCP19113 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDCP19113 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDCP19113 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HDCP19113 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDCP19113 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDCP19113 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDCP19113 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDCP19113 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDCP19113 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDCP19113 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDCP19113 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDCP19113 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDCP19113 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDCP19113 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDCP19113 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDCP19113 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDCP19113 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDCP19113 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDCP19113 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDCP19113 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDCP19113 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDCP19113 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDCP19113 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDCP19113 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDCP19113 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDCP19113 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDCP19113 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDCP19113 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDCP19113 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDCP19113 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDCP19113 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDCP19113 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDCP19113 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDCP19113 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDCP19113 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDCP19113 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDCP19113 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDCP19113 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDCP19113 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDCP19113 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDCP19113 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDCP19113 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HDCP19113 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDCP19113 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDCP19113 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDCP19113 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDCP19113 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDCP19113 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDCP19113 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDCP19113 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDCP19113 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDCP19113 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms