Protein–RNA interactions for Protein: P15086

CPB1, Carboxypeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB1P15086 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPB1P15086 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPB1P15086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPB1P15086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPB1P15086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPB1P15086 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPB1P15086 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPB1P15086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPB1P15086 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPB1P15086 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPB1P15086 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPB1P15086 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPB1P15086 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPB1P15086 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPB1P15086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPB1P15086 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CPB1P15086 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPB1P15086 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPB1P15086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPB1P15086 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPB1P15086 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPB1P15086 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPB1P15086 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPB1P15086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPB1P15086 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPB1P15086 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPB1P15086 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPB1P15086 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPB1P15086 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPB1P15086 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPB1P15086 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPB1P15086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPB1P15086 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPB1P15086 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPB1P15086 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPB1P15086 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPB1P15086 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPB1P15086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPB1P15086 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPB1P15086 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPB1P15086 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPB1P15086 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPB1P15086 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPB1P15086 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPB1P15086 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPB1P15086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPB1P15086 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPB1P15086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPB1P15086 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPB1P15086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPB1P15086 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPB1P15086 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CPB1P15086 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPB1P15086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPB1P15086 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPB1P15086 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPB1P15086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPB1P15086 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPB1P15086 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPB1P15086 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPB1P15086 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPB1P15086 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPB1P15086 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPB1P15086 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPB1P15086 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPB1P15086 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPB1P15086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPB1P15086 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPB1P15086 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPB1P15086 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPB1P15086 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPB1P15086 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPB1P15086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPB1P15086 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPB1P15086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPB1P15086 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPB1P15086 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPB1P15086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms