Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04436 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04436 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04436 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04436 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04436 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04436 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04436 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04436 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04436 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04436 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04436 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04436 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04436 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04436 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04436 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P04436 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P04436 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04436 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04436 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04436 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P04436 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P04436 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P04436 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04436 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04436 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04436 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04436 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P04436 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04436 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04436 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04436 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04436 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04436 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04436 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04436 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04436 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04436 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P04436 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P04436 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P04436 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms