Protein–RNA interactions for Protein: P04040

CAT, Catalase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATP04040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATP04040 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATP04040 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CATP04040 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATP04040 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATP04040 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATP04040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATP04040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATP04040 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATP04040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATP04040 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATP04040 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATP04040 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATP04040 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATP04040 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATP04040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATP04040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATP04040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATP04040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATP04040 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATP04040 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATP04040 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATP04040 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATP04040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATP04040 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATP04040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATP04040 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATP04040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATP04040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATP04040 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATP04040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATP04040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATP04040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CATP04040 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATP04040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATP04040 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATP04040 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATP04040 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATP04040 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATP04040 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATP04040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATP04040 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CATP04040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATP04040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATP04040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATP04040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATP04040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATP04040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATP04040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATP04040 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATP04040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATP04040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATP04040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATP04040 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATP04040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CATP04040 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATP04040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATP04040 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATP04040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATP04040 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATP04040 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATP04040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATP04040 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATP04040 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATP04040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CATP04040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms