Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGPS1O95749 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGPS1O95749 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GGPS1O95749 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GGPS1O95749 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGPS1O95749 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms