Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT4O95628 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT4O95628 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms