Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX2O60749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX2O60749 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX2O60749 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX2O60749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX2O60749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX2O60749 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX2O60749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX2O60749 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX2O60749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX2O60749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX2O60749 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX2O60749 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX2O60749 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX2O60749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX2O60749 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX2O60749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX2O60749 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX2O60749 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX2O60749 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX2O60749 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX2O60749 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX2O60749 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX2O60749 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX2O60749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX2O60749 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX2O60749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX2O60749 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX2O60749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX2O60749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX2O60749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX2O60749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX2O60749 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX2O60749 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX2O60749 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX2O60749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX2O60749 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX2O60749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX2O60749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX2O60749 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX2O60749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX2O60749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX2O60749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX2O60749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX2O60749 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX2O60749 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX2O60749 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms