Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC16AO15027 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16AO15027 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC16AO15027 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC16AO15027 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms