Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
H7C1W4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
H7C1W4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
H7C1W4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
H7C1W4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
H7C1W4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
H7C1W4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
H7C1W4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1W4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1W4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1W4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1W4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
H7C1W4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
H7C1W4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
H7C1W4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
H7C1W4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1W4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1W4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1W4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1W4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1W4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1W4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1W4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1W4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1W4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
H7C1W4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
H7C1W4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
H7C1W4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
H7C1W4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
H7C1W4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
H7C1W4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
H7C1W4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1W4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1W4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1W4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1W4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1W4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1W4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1W4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
H7C1W4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
H7C1W4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1W4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1W4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1W4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1W4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1W4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
H7C1W4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
H7C1W4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
H7C1W4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
H7C1W4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
H7C1W4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
H7C1W4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1W4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
H7C1W4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1W4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
H7C1W4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
H7C1W4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1W4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1W4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1W4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1W4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1W4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1W4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1W4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1W4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1W4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1W4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1W4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1W4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1W4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
H7C1W4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
H7C1W4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
H7C1W4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
H7C1W4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
H7C1W4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
H7C1W4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1W4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms