Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms