RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W TY1A-JR2P47099 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W GCR2Q01722 534 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-DR1Q03856 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-BRQ12217 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-NL2Q12470 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W TY1A-GR2Q12485 440 aa8.18□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W BRE2P43132 505 aa8.17□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W SEC2P17065 759 aa8.16□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W YPR109WQ06104 294 aa8.16□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W LAM6Q08001 693 aa8.16□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W RGR1P19263 1082 aa8.15□□□□□ -1.1
NSE4YDL105W AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W RRN7P40992 514 aa8.11□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W CLA4P48562 842 aa8.11□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W YPL062WQ02781 134 aa8.11□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W CDC4P07834 779 aa8.09□□□□□ -1.11
NSE4YDL105W BDP1P46678 594 aa8.08□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W CKB1P43639 278 aa8.06□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W HED1Q03937 162 aa8.06□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.04□□□□□ -1.12not detected
NSE4YDL105W KEX2P13134 814 aa8.03□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NSE4YDL105W PBS2P08018 668 aa8.02□□□□□ -1.13
NSE4YDL105W CLB5P30283 435 aa8.01□□□□□ -1.13
NSE4YDL105W ERF2Q06551 359 aa7.98□□□□□ -1.13
NSE4YDL105W RTF1P53064 558 aa7.95□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W ENV9Q08651 330 aa7.95□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W MOD5P07884 428 aa7.94□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W MET22P32179 357 aa7.94□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W MAM3Q12296 706 aa7.93□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W TUB4P53378 473 aa7.92□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W DMA1P38823 416 aa7.91□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W AGE1Q04412 482 aa7.91□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W ASH1P34233 588 aa7.9□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W YNL115CP53925 644 aa7.9□□□□□ -1.14
NSE4YDL105W AFT1P22149 690 aa7.89□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W HST3P53687 447 aa7.89□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W MET32Q12041 191 aa7.89□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W YDR444WQ04093 687 aa7.88□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W DSF2P38213 736 aa7.86□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W SIT4P20604 311 aa7.85□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W TEA1P47988 759 aa7.85□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W PUS5Q06244 254 aa7.85□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W IES2P40154 320 aa7.84□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W KXD1P53158 218 aa7.84□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
NSE4YDL105W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NSE4YDL105W TPD3P31383 635 aa7.82□□□□□ -1.16
NSE4YDL105W HXT10P43581 546 aa7.78□□□□□ -1.16
NSE4YDL105W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
NSE4YDL105W NIS1P53939 407 aa7.78□□□□□ -1.16
NSE4YDL105W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W YJR115WP47152 169 aa7.76□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W YDL176WQ12027 708 aa7.73□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W SLY41P22215 453 aa7.72□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W YMR196WQ04336 1088 aa7.72□□□□□ -1.17
NSE4YDL105W FPK1P53739 893 aa7.7□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W DIT2P21595 489 aa7.69□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W ALR1Q08269 859 aa7.69□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W UGA3P26370 528 aa7.68□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W RPA14P50106 137 aa7.68□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W PUS6P53294 404 aa7.68□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W TBF1Q02457 562 aa7.68□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W KIP2P28743 706 aa7.66□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W YPR097WQ06839 1073 aa7.66□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W RTT106P40161 455 aa7.65□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W YLR346CQ06139 101 aa7.65□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W YDL206WQ12424 762 aa7.65□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W SRF1Q12516 437 aa7.65□□□□□ -1.18
NSE4YDL105W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.63□□□□□ -1.19not detected
NSE4YDL105W PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W IXR1P33417 597 aa7.62□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W ACO2P39533 789 aa7.62□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W HST2P53686 357 aa7.62□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W OPT2Q06593 877 aa7.6□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W CAF120P53836 1060 aa7.59□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NSE4YDL105W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W MMP1Q12372 583 aa7.58□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W NUP85P46673 744 aa7.57□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W SCJ1P25303 377 aa7.56□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W ATF2P53296 535 aa7.54□□□□□ -1.2
NSE4YDL105W MIP1P15801 1254 aa7.52□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W SCW11P53189 542 aa7.52□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W ARG82P07250 355 aa7.49□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W VAC17P25591 423 aa7.49□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W TRK2P28584 889 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.3 ms