Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDY1Q9Y6F8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDY1Q9Y6F8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CDY1Q9Y6F8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDY1Q9Y6F8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDY1Q9Y6F8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDY1Q9Y6F8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDY1Q9Y6F8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CDY1Q9Y6F8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDY1Q9Y6F8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDY1Q9Y6F8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDY1Q9Y6F8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDY1Q9Y6F8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDY1Q9Y6F8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDY1Q9Y6F8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDY1Q9Y6F8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDY1Q9Y6F8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDY1Q9Y6F8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDY1Q9Y6F8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDY1Q9Y6F8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDY1Q9Y6F8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDY1Q9Y6F8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDY1Q9Y6F8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDY1Q9Y6F8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDY1Q9Y6F8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDY1Q9Y6F8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDY1Q9Y6F8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDY1Q9Y6F8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDY1Q9Y6F8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDY1Q9Y6F8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDY1Q9Y6F8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDY1Q9Y6F8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDY1Q9Y6F8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDY1Q9Y6F8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDY1Q9Y6F8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDY1Q9Y6F8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDY1Q9Y6F8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CDY1Q9Y6F8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDY1Q9Y6F8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDY1Q9Y6F8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDY1Q9Y6F8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDY1Q9Y6F8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CDY1Q9Y6F8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDY1Q9Y6F8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDY1Q9Y6F8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CDY1Q9Y6F8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDY1Q9Y6F8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDY1Q9Y6F8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDY1Q9Y6F8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDY1Q9Y6F8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDY1Q9Y6F8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDY1Q9Y6F8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDY1Q9Y6F8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDY1Q9Y6F8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDY1Q9Y6F8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDY1Q9Y6F8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDY1Q9Y6F8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDY1Q9Y6F8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDY1Q9Y6F8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDY1Q9Y6F8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDY1Q9Y6F8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDY1Q9Y6F8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDY1Q9Y6F8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDY1Q9Y6F8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDY1Q9Y6F8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CDY1Q9Y6F8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDY1Q9Y6F8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDY1Q9Y6F8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDY1Q9Y6F8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDY1Q9Y6F8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDY1Q9Y6F8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDY1Q9Y6F8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDY1Q9Y6F8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDY1Q9Y6F8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDY1Q9Y6F8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDY1Q9Y6F8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDY1Q9Y6F8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDY1Q9Y6F8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDY1Q9Y6F8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDY1Q9Y6F8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDY1Q9Y6F8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDY1Q9Y6F8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDY1Q9Y6F8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDY1Q9Y6F8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDY1Q9Y6F8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDY1Q9Y6F8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDY1Q9Y6F8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDY1Q9Y6F8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms