Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.45■■■■■ 5.67
STAG3Q9UJ98 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.11■■■■■ 5.61
STAG3Q9UJ98 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
STAG3Q9UJ98 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
STAG3Q9UJ98 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
STAG3Q9UJ98 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
STAG3Q9UJ98 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
STAG3Q9UJ98 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
STAG3Q9UJ98 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
STAG3Q9UJ98 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
STAG3Q9UJ98 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
STAG3Q9UJ98 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
STAG3Q9UJ98 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
STAG3Q9UJ98 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
STAG3Q9UJ98 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
STAG3Q9UJ98 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
STAG3Q9UJ98 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
STAG3Q9UJ98 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
STAG3Q9UJ98 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
STAG3Q9UJ98 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
STAG3Q9UJ98 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
STAG3Q9UJ98 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
STAG3Q9UJ98 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
STAG3Q9UJ98 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
STAG3Q9UJ98 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
STAG3Q9UJ98 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
STAG3Q9UJ98 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
STAG3Q9UJ98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
STAG3Q9UJ98 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
STAG3Q9UJ98 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
STAG3Q9UJ98 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
STAG3Q9UJ98 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
STAG3Q9UJ98 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
STAG3Q9UJ98 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
STAG3Q9UJ98 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
STAG3Q9UJ98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
STAG3Q9UJ98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
STAG3Q9UJ98 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
STAG3Q9UJ98 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
STAG3Q9UJ98 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
STAG3Q9UJ98 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
STAG3Q9UJ98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
STAG3Q9UJ98 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
STAG3Q9UJ98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
STAG3Q9UJ98 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
STAG3Q9UJ98 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
STAG3Q9UJ98 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
STAG3Q9UJ98 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
STAG3Q9UJ98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
STAG3Q9UJ98 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
STAG3Q9UJ98 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
STAG3Q9UJ98 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
STAG3Q9UJ98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
STAG3Q9UJ98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
STAG3Q9UJ98 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
STAG3Q9UJ98 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
STAG3Q9UJ98 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
STAG3Q9UJ98 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
STAG3Q9UJ98 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
STAG3Q9UJ98 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
STAG3Q9UJ98 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
STAG3Q9UJ98 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
STAG3Q9UJ98 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
STAG3Q9UJ98 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
STAG3Q9UJ98 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
STAG3Q9UJ98 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
STAG3Q9UJ98 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
STAG3Q9UJ98 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
STAG3Q9UJ98 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
STAG3Q9UJ98 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
STAG3Q9UJ98 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
STAG3Q9UJ98 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
STAG3Q9UJ98 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
STAG3Q9UJ98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
STAG3Q9UJ98 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
STAG3Q9UJ98 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
STAG3Q9UJ98 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
STAG3Q9UJ98 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
STAG3Q9UJ98 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
STAG3Q9UJ98 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
STAG3Q9UJ98 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
STAG3Q9UJ98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.53
STAG3Q9UJ98 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
STAG3Q9UJ98 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
STAG3Q9UJ98 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
STAG3Q9UJ98 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
STAG3Q9UJ98 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
STAG3Q9UJ98 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
STAG3Q9UJ98 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
STAG3Q9UJ98 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
STAG3Q9UJ98 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
STAG3Q9UJ98 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
STAG3Q9UJ98 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
STAG3Q9UJ98 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
STAG3Q9UJ98 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
STAG3Q9UJ98 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
STAG3Q9UJ98 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
STAG3Q9UJ98 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
STAG3Q9UJ98 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
STAG3Q9UJ98 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms