Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCDH10Q9P2E7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCDH10Q9P2E7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PCDH10Q9P2E7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PCDH10Q9P2E7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PCDH10Q9P2E7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCDH10Q9P2E7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PCDH10Q9P2E7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PCDH10Q9P2E7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PCDH10Q9P2E7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCDH10Q9P2E7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCDH10Q9P2E7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCDH10Q9P2E7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCDH10Q9P2E7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCDH10Q9P2E7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PCDH10Q9P2E7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCDH10Q9P2E7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCDH10Q9P2E7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCDH10Q9P2E7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PCDH10Q9P2E7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PCDH10Q9P2E7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCDH10Q9P2E7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCDH10Q9P2E7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCDH10Q9P2E7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCDH10Q9P2E7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PCDH10Q9P2E7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDH10Q9P2E7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDH10Q9P2E7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDH10Q9P2E7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDH10Q9P2E7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCDH10Q9P2E7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PCDH10Q9P2E7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCDH10Q9P2E7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCDH10Q9P2E7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCDH10Q9P2E7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCDH10Q9P2E7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PCDH10Q9P2E7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PCDH10Q9P2E7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCDH10Q9P2E7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PCDH10Q9P2E7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PCDH10Q9P2E7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCDH10Q9P2E7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCDH10Q9P2E7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCDH10Q9P2E7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCDH10Q9P2E7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCDH10Q9P2E7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCDH10Q9P2E7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCDH10Q9P2E7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCDH10Q9P2E7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCDH10Q9P2E7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCDH10Q9P2E7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCDH10Q9P2E7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCDH10Q9P2E7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCDH10Q9P2E7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCDH10Q9P2E7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCDH10Q9P2E7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCDH10Q9P2E7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCDH10Q9P2E7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDH10Q9P2E7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDH10Q9P2E7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCDH10Q9P2E7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PCDH10Q9P2E7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDH10Q9P2E7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDH10Q9P2E7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCDH10Q9P2E7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDH10Q9P2E7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCDH10Q9P2E7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCDH10Q9P2E7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCDH10Q9P2E7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PCDH10Q9P2E7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PCDH10Q9P2E7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PCDH10Q9P2E7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCDH10Q9P2E7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDH10Q9P2E7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDH10Q9P2E7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PCDH10Q9P2E7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCDH10Q9P2E7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCDH10Q9P2E7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PCDH10Q9P2E7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PCDH10Q9P2E7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDH10Q9P2E7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDH10Q9P2E7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDH10Q9P2E7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDH10Q9P2E7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDH10Q9P2E7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDH10Q9P2E7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCDH10Q9P2E7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDH10Q9P2E7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDH10Q9P2E7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PCDH10Q9P2E7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PCDH10Q9P2E7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDH10Q9P2E7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDH10Q9P2E7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDH10Q9P2E7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDH10Q9P2E7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PCDH10Q9P2E7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCDH10Q9P2E7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCDH10Q9P2E7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms