Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PARVAQ9NVD7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PARVAQ9NVD7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
PARVAQ9NVD7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PARVAQ9NVD7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PARVAQ9NVD7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PARVAQ9NVD7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PARVAQ9NVD7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PARVAQ9NVD7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PARVAQ9NVD7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PARVAQ9NVD7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PARVAQ9NVD7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PARVAQ9NVD7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARVAQ9NVD7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PARVAQ9NVD7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PARVAQ9NVD7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARVAQ9NVD7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARVAQ9NVD7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PARVAQ9NVD7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PARVAQ9NVD7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PARVAQ9NVD7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PARVAQ9NVD7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PARVAQ9NVD7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PARVAQ9NVD7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PARVAQ9NVD7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARVAQ9NVD7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PARVAQ9NVD7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARVAQ9NVD7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARVAQ9NVD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARVAQ9NVD7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARVAQ9NVD7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PARVAQ9NVD7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARVAQ9NVD7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARVAQ9NVD7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PARVAQ9NVD7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PARVAQ9NVD7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PARVAQ9NVD7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PARVAQ9NVD7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARVAQ9NVD7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PARVAQ9NVD7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PARVAQ9NVD7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PARVAQ9NVD7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARVAQ9NVD7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PARVAQ9NVD7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PARVAQ9NVD7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PARVAQ9NVD7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PARVAQ9NVD7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PARVAQ9NVD7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARVAQ9NVD7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PARVAQ9NVD7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARVAQ9NVD7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PARVAQ9NVD7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PARVAQ9NVD7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PARVAQ9NVD7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PARVAQ9NVD7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARVAQ9NVD7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PARVAQ9NVD7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PARVAQ9NVD7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PARVAQ9NVD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PARVAQ9NVD7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PARVAQ9NVD7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARVAQ9NVD7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARVAQ9NVD7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARVAQ9NVD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARVAQ9NVD7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PARVAQ9NVD7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PARVAQ9NVD7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARVAQ9NVD7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARVAQ9NVD7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARVAQ9NVD7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARVAQ9NVD7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARVAQ9NVD7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARVAQ9NVD7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARVAQ9NVD7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARVAQ9NVD7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARVAQ9NVD7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARVAQ9NVD7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PARVAQ9NVD7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PARVAQ9NVD7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PARVAQ9NVD7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PARVAQ9NVD7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PARVAQ9NVD7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PARVAQ9NVD7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PARVAQ9NVD7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARVAQ9NVD7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARVAQ9NVD7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARVAQ9NVD7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARVAQ9NVD7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARVAQ9NVD7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARVAQ9NVD7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARVAQ9NVD7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARVAQ9NVD7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARVAQ9NVD7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms