Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RRAGCQ9HB90 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RRAGCQ9HB90 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RRAGCQ9HB90 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RRAGCQ9HB90 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RRAGCQ9HB90 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRAGCQ9HB90 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRAGCQ9HB90 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RRAGCQ9HB90 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRAGCQ9HB90 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RRAGCQ9HB90 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RRAGCQ9HB90 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
RRAGCQ9HB90 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RRAGCQ9HB90 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RRAGCQ9HB90 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
RRAGCQ9HB90 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RRAGCQ9HB90 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
RRAGCQ9HB90 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RRAGCQ9HB90 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RRAGCQ9HB90 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RRAGCQ9HB90 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RRAGCQ9HB90 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RRAGCQ9HB90 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RRAGCQ9HB90 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
RRAGCQ9HB90 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RRAGCQ9HB90 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RRAGCQ9HB90 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RRAGCQ9HB90 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
RRAGCQ9HB90 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RRAGCQ9HB90 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RRAGCQ9HB90 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RRAGCQ9HB90 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RRAGCQ9HB90 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRAGCQ9HB90 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRAGCQ9HB90 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RRAGCQ9HB90 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RRAGCQ9HB90 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
RRAGCQ9HB90 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRAGCQ9HB90 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RRAGCQ9HB90 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RRAGCQ9HB90 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRAGCQ9HB90 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRAGCQ9HB90 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RRAGCQ9HB90 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RRAGCQ9HB90 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
RRAGCQ9HB90 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRAGCQ9HB90 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RRAGCQ9HB90 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RRAGCQ9HB90 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRAGCQ9HB90 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RRAGCQ9HB90 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRAGCQ9HB90 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RRAGCQ9HB90 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RRAGCQ9HB90 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRAGCQ9HB90 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRAGCQ9HB90 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRAGCQ9HB90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRAGCQ9HB90 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRAGCQ9HB90 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRAGCQ9HB90 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRAGCQ9HB90 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRAGCQ9HB90 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRAGCQ9HB90 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRAGCQ9HB90 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRAGCQ9HB90 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRAGCQ9HB90 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RRAGCQ9HB90 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRAGCQ9HB90 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRAGCQ9HB90 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRAGCQ9HB90 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RRAGCQ9HB90 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRAGCQ9HB90 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRAGCQ9HB90 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRAGCQ9HB90 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRAGCQ9HB90 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RRAGCQ9HB90 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRAGCQ9HB90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RRAGCQ9HB90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRAGCQ9HB90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RRAGCQ9HB90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRAGCQ9HB90 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RRAGCQ9HB90 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RRAGCQ9HB90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RRAGCQ9HB90 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRAGCQ9HB90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RRAGCQ9HB90 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RRAGCQ9HB90 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RRAGCQ9HB90 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RRAGCQ9HB90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RRAGCQ9HB90 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RRAGCQ9HB90 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RRAGCQ9HB90 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RRAGCQ9HB90 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRAGCQ9HB90 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRAGCQ9HB90 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRAGCQ9HB90 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRAGCQ9HB90 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRAGCQ9HB90 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRAGCQ9HB90 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRAGCQ9HB90 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms