Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
CLSPNQ9HAW4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.6■■■■■ 5.53
CLSPNQ9HAW4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
CLSPNQ9HAW4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.6■■■■■ 5.37
CLSPNQ9HAW4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CLSPNQ9HAW4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.33
CLSPNQ9HAW4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
CLSPNQ9HAW4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CLSPNQ9HAW4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
CLSPNQ9HAW4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
CLSPNQ9HAW4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
CLSPNQ9HAW4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CLSPNQ9HAW4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CLSPNQ9HAW4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
CLSPNQ9HAW4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CLSPNQ9HAW4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CLSPNQ9HAW4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
CLSPNQ9HAW4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CLSPNQ9HAW4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
CLSPNQ9HAW4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CLSPNQ9HAW4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CLSPNQ9HAW4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CLSPNQ9HAW4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CLSPNQ9HAW4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CLSPNQ9HAW4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CLSPNQ9HAW4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CLSPNQ9HAW4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CLSPNQ9HAW4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CLSPNQ9HAW4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CLSPNQ9HAW4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CLSPNQ9HAW4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CLSPNQ9HAW4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CLSPNQ9HAW4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CLSPNQ9HAW4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CLSPNQ9HAW4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CLSPNQ9HAW4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CLSPNQ9HAW4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CLSPNQ9HAW4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CLSPNQ9HAW4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
CLSPNQ9HAW4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CLSPNQ9HAW4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CLSPNQ9HAW4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CLSPNQ9HAW4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CLSPNQ9HAW4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CLSPNQ9HAW4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CLSPNQ9HAW4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CLSPNQ9HAW4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CLSPNQ9HAW4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CLSPNQ9HAW4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CLSPNQ9HAW4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CLSPNQ9HAW4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CLSPNQ9HAW4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CLSPNQ9HAW4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CLSPNQ9HAW4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CLSPNQ9HAW4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CLSPNQ9HAW4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CLSPNQ9HAW4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CLSPNQ9HAW4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CLSPNQ9HAW4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CLSPNQ9HAW4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CLSPNQ9HAW4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CLSPNQ9HAW4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CLSPNQ9HAW4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CLSPNQ9HAW4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CLSPNQ9HAW4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CLSPNQ9HAW4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CLSPNQ9HAW4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CLSPNQ9HAW4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CLSPNQ9HAW4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CLSPNQ9HAW4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CLSPNQ9HAW4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CLSPNQ9HAW4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CLSPNQ9HAW4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
CLSPNQ9HAW4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CLSPNQ9HAW4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CLSPNQ9HAW4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CLSPNQ9HAW4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CLSPNQ9HAW4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CLSPNQ9HAW4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CLSPNQ9HAW4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
CLSPNQ9HAW4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CLSPNQ9HAW4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CLSPNQ9HAW4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CLSPNQ9HAW4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CLSPNQ9HAW4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLSPNQ9HAW4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CLSPNQ9HAW4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CLSPNQ9HAW4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLSPNQ9HAW4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CLSPNQ9HAW4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CLSPNQ9HAW4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CLSPNQ9HAW4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CLSPNQ9HAW4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLSPNQ9HAW4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLSPNQ9HAW4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CLSPNQ9HAW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CLSPNQ9HAW4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms