Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMOC1Q9H4F8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMOC1Q9H4F8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SMOC1Q9H4F8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMOC1Q9H4F8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMOC1Q9H4F8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMOC1Q9H4F8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMOC1Q9H4F8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMOC1Q9H4F8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMOC1Q9H4F8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMOC1Q9H4F8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SMOC1Q9H4F8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMOC1Q9H4F8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMOC1Q9H4F8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMOC1Q9H4F8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMOC1Q9H4F8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMOC1Q9H4F8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMOC1Q9H4F8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMOC1Q9H4F8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SMOC1Q9H4F8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SMOC1Q9H4F8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SMOC1Q9H4F8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SMOC1Q9H4F8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SMOC1Q9H4F8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SMOC1Q9H4F8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SMOC1Q9H4F8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SMOC1Q9H4F8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SMOC1Q9H4F8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SMOC1Q9H4F8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SMOC1Q9H4F8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SMOC1Q9H4F8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMOC1Q9H4F8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SMOC1Q9H4F8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SMOC1Q9H4F8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SMOC1Q9H4F8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMOC1Q9H4F8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMOC1Q9H4F8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SMOC1Q9H4F8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMOC1Q9H4F8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMOC1Q9H4F8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMOC1Q9H4F8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMOC1Q9H4F8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMOC1Q9H4F8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SMOC1Q9H4F8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMOC1Q9H4F8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMOC1Q9H4F8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMOC1Q9H4F8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMOC1Q9H4F8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMOC1Q9H4F8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMOC1Q9H4F8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMOC1Q9H4F8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMOC1Q9H4F8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMOC1Q9H4F8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMOC1Q9H4F8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMOC1Q9H4F8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMOC1Q9H4F8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMOC1Q9H4F8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMOC1Q9H4F8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMOC1Q9H4F8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMOC1Q9H4F8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMOC1Q9H4F8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMOC1Q9H4F8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMOC1Q9H4F8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMOC1Q9H4F8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMOC1Q9H4F8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMOC1Q9H4F8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMOC1Q9H4F8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMOC1Q9H4F8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMOC1Q9H4F8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMOC1Q9H4F8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMOC1Q9H4F8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMOC1Q9H4F8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMOC1Q9H4F8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMOC1Q9H4F8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMOC1Q9H4F8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMOC1Q9H4F8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMOC1Q9H4F8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMOC1Q9H4F8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMOC1Q9H4F8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMOC1Q9H4F8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMOC1Q9H4F8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMOC1Q9H4F8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMOC1Q9H4F8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMOC1Q9H4F8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMOC1Q9H4F8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMOC1Q9H4F8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMOC1Q9H4F8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMOC1Q9H4F8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMOC1Q9H4F8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMOC1Q9H4F8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMOC1Q9H4F8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMOC1Q9H4F8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMOC1Q9H4F8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms