Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MTIF3Q9H2K0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MTIF3Q9H2K0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MTIF3Q9H2K0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MTIF3Q9H2K0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MTIF3Q9H2K0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MTIF3Q9H2K0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MTIF3Q9H2K0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MTIF3Q9H2K0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MTIF3Q9H2K0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MTIF3Q9H2K0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MTIF3Q9H2K0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
MTIF3Q9H2K0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTIF3Q9H2K0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MTIF3Q9H2K0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MTIF3Q9H2K0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MTIF3Q9H2K0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MTIF3Q9H2K0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MTIF3Q9H2K0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MTIF3Q9H2K0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MTIF3Q9H2K0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MTIF3Q9H2K0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MTIF3Q9H2K0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MTIF3Q9H2K0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTIF3Q9H2K0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTIF3Q9H2K0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTIF3Q9H2K0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTIF3Q9H2K0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
MTIF3Q9H2K0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
MTIF3Q9H2K0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MTIF3Q9H2K0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MTIF3Q9H2K0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MTIF3Q9H2K0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MTIF3Q9H2K0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MTIF3Q9H2K0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MTIF3Q9H2K0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MTIF3Q9H2K0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MTIF3Q9H2K0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MTIF3Q9H2K0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MTIF3Q9H2K0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MTIF3Q9H2K0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
MTIF3Q9H2K0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MTIF3Q9H2K0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MTIF3Q9H2K0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MTIF3Q9H2K0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MTIF3Q9H2K0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MTIF3Q9H2K0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MTIF3Q9H2K0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MTIF3Q9H2K0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MTIF3Q9H2K0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MTIF3Q9H2K0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MTIF3Q9H2K0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MTIF3Q9H2K0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MTIF3Q9H2K0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
MTIF3Q9H2K0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MTIF3Q9H2K0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MTIF3Q9H2K0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MTIF3Q9H2K0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MTIF3Q9H2K0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MTIF3Q9H2K0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MTIF3Q9H2K0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MTIF3Q9H2K0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MTIF3Q9H2K0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MTIF3Q9H2K0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MTIF3Q9H2K0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MTIF3Q9H2K0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MTIF3Q9H2K0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MTIF3Q9H2K0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MTIF3Q9H2K0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MTIF3Q9H2K0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MTIF3Q9H2K0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MTIF3Q9H2K0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MTIF3Q9H2K0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MTIF3Q9H2K0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MTIF3Q9H2K0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MTIF3Q9H2K0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MTIF3Q9H2K0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MTIF3Q9H2K0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MTIF3Q9H2K0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MTIF3Q9H2K0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MTIF3Q9H2K0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MTIF3Q9H2K0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MTIF3Q9H2K0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MTIF3Q9H2K0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MTIF3Q9H2K0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MTIF3Q9H2K0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MTIF3Q9H2K0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MTIF3Q9H2K0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MTIF3Q9H2K0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MTIF3Q9H2K0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MTIF3Q9H2K0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
MTIF3Q9H2K0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MTIF3Q9H2K0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MTIF3Q9H2K0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MTIF3Q9H2K0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MTIF3Q9H2K0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MTIF3Q9H2K0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MTIF3Q9H2K0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MTIF3Q9H2K0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MTIF3Q9H2K0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms