Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.43■■■■■ 6.14
CFAP74Q9C0B2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.33■■■■■ 6.13
CFAP74Q9C0B2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.73■■■■■ 6.03
CFAP74Q9C0B2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
CFAP74Q9C0B2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
CFAP74Q9C0B2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.16■■■■■ 5.78
CFAP74Q9C0B2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.01■■■■■ 5.76
CFAP74Q9C0B2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
CFAP74Q9C0B2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
CFAP74Q9C0B2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
CFAP74Q9C0B2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CFAP74Q9C0B2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
CFAP74Q9C0B2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.61■■■■■ 5.69
CFAP74Q9C0B2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
CFAP74Q9C0B2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
CFAP74Q9C0B2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CFAP74Q9C0B2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
CFAP74Q9C0B2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
CFAP74Q9C0B2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CFAP74Q9C0B2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CFAP74Q9C0B2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CFAP74Q9C0B2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CFAP74Q9C0B2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
CFAP74Q9C0B2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.47
CFAP74Q9C0B2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CFAP74Q9C0B2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
CFAP74Q9C0B2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
CFAP74Q9C0B2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CFAP74Q9C0B2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.79■■■■■ 5.4
CFAP74Q9C0B2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
CFAP74Q9C0B2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
CFAP74Q9C0B2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CFAP74Q9C0B2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
CFAP74Q9C0B2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
CFAP74Q9C0B2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.14■■■■■ 5.3
CFAP74Q9C0B2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.13■■■■■ 5.29
CFAP74Q9C0B2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CFAP74Q9C0B2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
CFAP74Q9C0B2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
CFAP74Q9C0B2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CFAP74Q9C0B2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
CFAP74Q9C0B2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CFAP74Q9C0B2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CFAP74Q9C0B2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CFAP74Q9C0B2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
CFAP74Q9C0B2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CFAP74Q9C0B2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
CFAP74Q9C0B2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
CFAP74Q9C0B2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CFAP74Q9C0B2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CFAP74Q9C0B2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
CFAP74Q9C0B2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CFAP74Q9C0B2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CFAP74Q9C0B2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
CFAP74Q9C0B2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CFAP74Q9C0B2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CFAP74Q9C0B2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
CFAP74Q9C0B2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
CFAP74Q9C0B2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
CFAP74Q9C0B2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CFAP74Q9C0B2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
CFAP74Q9C0B2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
CFAP74Q9C0B2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CFAP74Q9C0B2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CFAP74Q9C0B2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
CFAP74Q9C0B2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.3■■■■■ 5
CFAP74Q9C0B2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CFAP74Q9C0B2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CFAP74Q9C0B2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CFAP74Q9C0B2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.13■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CFAP74Q9C0B2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
CFAP74Q9C0B2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
CFAP74Q9C0B2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CFAP74Q9C0B2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CFAP74Q9C0B2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
CFAP74Q9C0B2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
CFAP74Q9C0B2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.93
CFAP74Q9C0B2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CFAP74Q9C0B2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CFAP74Q9C0B2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CFAP74Q9C0B2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CFAP74Q9C0B2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
CFAP74Q9C0B2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CFAP74Q9C0B2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
CFAP74Q9C0B2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms