Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KIFC3Q9BVG8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIFC3Q9BVG8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KIFC3Q9BVG8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
KIFC3Q9BVG8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIFC3Q9BVG8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KIFC3Q9BVG8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIFC3Q9BVG8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KIFC3Q9BVG8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIFC3Q9BVG8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KIFC3Q9BVG8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KIFC3Q9BVG8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIFC3Q9BVG8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KIFC3Q9BVG8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KIFC3Q9BVG8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIFC3Q9BVG8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIFC3Q9BVG8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KIFC3Q9BVG8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
KIFC3Q9BVG8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KIFC3Q9BVG8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KIFC3Q9BVG8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KIFC3Q9BVG8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIFC3Q9BVG8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIFC3Q9BVG8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KIFC3Q9BVG8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KIFC3Q9BVG8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIFC3Q9BVG8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIFC3Q9BVG8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIFC3Q9BVG8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIFC3Q9BVG8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIFC3Q9BVG8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIFC3Q9BVG8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIFC3Q9BVG8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KIFC3Q9BVG8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIFC3Q9BVG8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIFC3Q9BVG8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KIFC3Q9BVG8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KIFC3Q9BVG8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIFC3Q9BVG8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIFC3Q9BVG8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KIFC3Q9BVG8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIFC3Q9BVG8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIFC3Q9BVG8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIFC3Q9BVG8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIFC3Q9BVG8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIFC3Q9BVG8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIFC3Q9BVG8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIFC3Q9BVG8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
KIFC3Q9BVG8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIFC3Q9BVG8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIFC3Q9BVG8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIFC3Q9BVG8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIFC3Q9BVG8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIFC3Q9BVG8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KIFC3Q9BVG8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIFC3Q9BVG8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIFC3Q9BVG8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIFC3Q9BVG8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KIFC3Q9BVG8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KIFC3Q9BVG8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
KIFC3Q9BVG8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KIFC3Q9BVG8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KIFC3Q9BVG8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
KIFC3Q9BVG8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIFC3Q9BVG8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIFC3Q9BVG8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIFC3Q9BVG8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIFC3Q9BVG8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIFC3Q9BVG8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIFC3Q9BVG8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIFC3Q9BVG8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIFC3Q9BVG8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIFC3Q9BVG8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIFC3Q9BVG8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIFC3Q9BVG8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIFC3Q9BVG8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIFC3Q9BVG8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KIFC3Q9BVG8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KIFC3Q9BVG8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIFC3Q9BVG8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIFC3Q9BVG8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIFC3Q9BVG8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KIFC3Q9BVG8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KIFC3Q9BVG8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KIFC3Q9BVG8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIFC3Q9BVG8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KIFC3Q9BVG8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KIFC3Q9BVG8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KIFC3Q9BVG8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KIFC3Q9BVG8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIFC3Q9BVG8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIFC3Q9BVG8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KIFC3Q9BVG8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIFC3Q9BVG8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIFC3Q9BVG8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms