Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT3Q9BQG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT3Q9BQG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT3Q9BQG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT3Q9BQG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT3Q9BQG1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT3Q9BQG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT3Q9BQG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT3Q9BQG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT3Q9BQG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT3Q9BQG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT3Q9BQG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYT3Q9BQG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYT3Q9BQG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SYT3Q9BQG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT3Q9BQG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT3Q9BQG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT3Q9BQG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT3Q9BQG1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT3Q9BQG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT3Q9BQG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT3Q9BQG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT3Q9BQG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYT3Q9BQG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT3Q9BQG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT3Q9BQG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT3Q9BQG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT3Q9BQG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT3Q9BQG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT3Q9BQG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT3Q9BQG1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYT3Q9BQG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYT3Q9BQG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT3Q9BQG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT3Q9BQG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT3Q9BQG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT3Q9BQG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT3Q9BQG1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT3Q9BQG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT3Q9BQG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT3Q9BQG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT3Q9BQG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT3Q9BQG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT3Q9BQG1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT3Q9BQG1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT3Q9BQG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT3Q9BQG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT3Q9BQG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT3Q9BQG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT3Q9BQG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT3Q9BQG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT3Q9BQG1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT3Q9BQG1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT3Q9BQG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT3Q9BQG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT3Q9BQG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT3Q9BQG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT3Q9BQG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT3Q9BQG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT3Q9BQG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT3Q9BQG1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT3Q9BQG1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT3Q9BQG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT3Q9BQG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT3Q9BQG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT3Q9BQG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT3Q9BQG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT3Q9BQG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT3Q9BQG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT3Q9BQG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT3Q9BQG1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT3Q9BQG1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT3Q9BQG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT3Q9BQG1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT3Q9BQG1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT3Q9BQG1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT3Q9BQG1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT3Q9BQG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT3Q9BQG1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT3Q9BQG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT3Q9BQG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT3Q9BQG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT3Q9BQG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT3Q9BQG1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT3Q9BQG1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT3Q9BQG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT3Q9BQG1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT3Q9BQG1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT3Q9BQG1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms